A Magyar Gyógyszerészi Kamara, valamint a pilotban részt vevő rendszergazdák javaslata alapján megkeresett gyógyszertárak fokozatos bekapcsolásával lehetőség nyílik a rendszerben megjelenő e-vények kezelésére. Ezeket úgy lehet azonosítani, hogy a vényen a megszokott vonalkódok mellett egy újabb látható, ami az adott vény EESZT-ben lévő azonosítója. Ez a vonalkód a naplószám alatti részen található.
A pilot időszakban minden expediáló szakember egy tokent kap, aminek segítségével be tud lépni a felhőszolgáltatásba. A tokeneket és a hozzá tartozó felhasználónevet és jelszót az ÁEEK munkatársai juttatják el a rendszergazdákon keresztül a pilot gyógyszertárakba. A felhasználói fiókok jogosultságai a működési nyilvántartás alapján lettek beállítva. A tervek szerint az éles üzemben nem tokenhez kötött lesz az azonosítás, hanem e-személyivel lehet könnyen és gyorsan belépni a rendszerbe. Az ehhez szükséges eszközöket a közeljövőben kapják meg a gyógyszertárak.
A kapott belépési adatokkal első lépésként be kell lépni az ún. ágazati portálra (porta.eeszt.gov.hu), ahol a kapott jelszót mindenki olyan jelszóra cseréli, amit jobban meg tud jegyezni és megfelel a minimum követelményeknek. Kell legyen benne legalább két kis és nagybetű, speciális karakter vagy szám. A rendszer használatához egy online vizsgát is le kell tenni, amihez a tananyagot az ÁEEK biztosítja és az EESZT, valamint a patikai rendszer ismeretéről szól. A vizsga tíz kérdésből áll és fél óra áll rendelkezésre a helyes válaszok bejelöléséhez.
A pilot során két féle módon felírt recepteket lehet kezelni.
